Το μή επεμβατικό τεστ ανίχνευσης του εμβρυϊκού DNA στο μητρικό αίμα δεν προσφέρει πληροφορίες γιά άλλες σπάνιες χρωμοσωμιακές ανωμαλίες. Αν η υπερηχογραφική εξέταση δείξει αυξημένη Αυχενική Διαφάνεια ή άλλες σοβαρές ανατομικές ανωμαλίες όπως εγκεφαλικές ανωμαλίες, συγγενείς καρδιοπάθειες, ο κίνδυνος κάποιων σπάνιων χρωμοσωμιακών ανωμαλιών μπορεί να είναι υψηλός. Σε αυτή τη περίπτωση ίσως να προτιμούσατε να επιλέξετε να υποβληθείτε σε κάποια επεμβατική μέθοδο όπως λήψη τροφοβλάστης ή αμνιοπαρακέντηση.
Το «Μη Επεμβατικό Προγεννετικό Τεστ» (NIPT) δεν προσφέρει πληροφορίες γιά άλλες ανατομικές ανωμαλίες όπως τη δισχιδή ράχη ή πληροφορίες σχετικά με την εμβρυϊκή ανάπτυξη. Για το λόγο αυτό συστήνεται να πραγμματοποιήσετε όλες τις ενδεδειγμένες υπερηχογραφικές εξετάσεις της εγκυμοσύνης.